שכונת גני יהודה ממוקמת בבקעת אונו בין היישובים יהוד, קריית אונו וסביון.
שכונה זו מאופיינת בנגישות גבוהה למרכזי התעסוקה והבילוי הגדולים במרכז ותל אביב בפרט, ע"י רשת של כבישים קווי אוטובוס מהירים וחיבור עתידי לרכבת הקלה.
רכבת קלה
הקו הסגול של הרכבת, אשר כעת בבנייה ועתיד להסתיים ב2027 יעבור דרך כביש 461, עם תחנה בצומת סביון.
קו זה יעבור בערים קריית אנו, רמת גן וגבעתיים, ורובו יעבור דרך מרכז ת"א.
קו זה יהווה עורק תחבורה חשוב ונוח לתחנות ומיקומים אסטרטגיים רבים, כגון: ביה"ח שיבא, מחלף אלוף שדה, תחנת רכבת השלום, רחובות מרכזיים בת"א כמו אלנבי ואבן גבירול וסיום הקו בתחנת רכבת "סבידור".
כבישים
דרומית לשכונה עובר כביש 461 עם יציאה לשכונה מצומת סביון אשר מתחבר ישירות לתל אביב או למחלף מסובים ומשם לכביש 4.
מערבית לשכונה עובר כביש 4622 המחברת בין החלק הדרומי של יהוד, אור יהודה, סביון וקריית אונו.
אוטובוסים
קווי אוטובוסים (חברת קווים): 36 (ת"א-אוניברסיטה), 37 (ת"א-ת. מרכזית), 55 (ת"א-רידינג), 56 (ת"א-רידינג), 68 (ת"א-ת. מרכזית), 137 (ת"א-אוניברסיטה), 168 (ת"א-כרמלית), 236 (כרמלית), 268 (ת"א-ת. מרכזית)
כמו כן, מתוכננים להיבנות נתצ"ים, על ציר 461 מצומת הטייסים עד לצומת אריאל שרון, ובציר 4622 מצומת סביון עד מע"ר קריית אונו.
בנוסף, מתוכנן בניית מערך דרכים וקווי אוטובוסים פנימית שיהוו את השלד התחבורתי הן לתח"צ והן לרכב הפרטי, וגם החיבורים לעירים השכנות.